改变点和颜色框架的颜色/椭圆围绕这一点

我想从我开始用户的事实开始 R 特别是这个网站，所以如果你需要一些东西可以在这里澄清，请告诉我！ 我仍然不太了解一切，所以请不要犹豫 "dumb down", 越多越好。

问题：我想创造 PCA 描绘两组的图形 /在这种情况下，类型/. 我也想在他们周围绘制椭圆或框架。

幸运的是，我使用了这项任务 ggplot2!
但是，我无法改变点或椭圆的颜色/默认值之外的帧。

你能否在这件事上建议一些帮助？

请参阅下面的代码示例，这只是传统的数据集。 iris, 经常在例子中使用 PCA.


###load in plackages###

library/ggbiplot/

library/ggfortify/

library/cluster/



#my actual data is very similar to the iris data, though in my data the "Species" column is first

head/iris/

Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species

1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa

2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa

3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa

4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa

5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa

6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa

df <- iris[c/1, 2, 3, 4/]

autoplot/prcomp/df//

autoplot/prcomp/df/, data = iris, colour = 'Species'/ #pca graph with species depicted in different colors



autoplot/prcomp/df/, data = iris, colour = 'Species', shape='Species', frame=T/
2021-03-20 添加评论
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    已邀请:

    龙天

    赞同来自:

    我做了一样 PCA


    data<-iris
    
df<-iris[c/1, 2, 3, 4/]
    
PC<-prcomp/df/
    
PCi<-data.frame/PC$x,Species=data$Species/


    现在您进行定期计划并更改参数
    ggplot

    , 照常


    ggplot/PCi,aes/x=PC1,y=PC2,col=Species//+
    
 geom_point/size=3,alpha=0.5/+ #Size and alpha just for fun
    
 scale_color_manual/values = c/"#FF1BB3","#A7FF5B","#99554D"//+ #your colors here
    
 theme_classic//


    https://i.stack.imgur.com/RMdrH.png
    此外，检查
    scale_fill_manual

    框架

    EDIT

    我认为添加框架应该更容易，在这里检查。
    https://stats.stackexchange.co ... plot2
    和这里
    https://coderoad.ru/25449093/
    另外，我还在思考 , 什么 ggbiplot 必须处理
    scale_color_manual

    和
    scale_fill_manual

    , 你能更新失败的问题吗？
    2021-03-21 0 0
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    卫东

    赞同来自:

    令人惊叹的酱！

    答案在这些例子中没有完全隐藏，但我发现了 scale_color_manual 和 scale_fill_manual 完全包含我想要改变任何周到颜色的框架！


    #using autoplot from earlier, I placed it into an object
    
a<-autoplot/prcomp/df/, data = iris, colour = 'Species', shape='Species', frame=T/
    
#then I added on scale_color_manual and scale_fill_manual with the wacky color combos that would never be publishable 
    
a + scale_fill_manual/values = c/"#FF1BB3","#A7FF5B","#99554D"// + scale_color_manual/values = c/"black","white","orange"//


    http://i.stack.imgur.com/U10mX.png
    非常感谢您的帮助！ 非常感谢这个小的事实 /或者相反，非常大/ 这个小组在这里！
    2021-03-21 0 0
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